이반 4세 당시 모스크바는 킵차크 칸국의 잔존 세력들에 위협을 받고 있었다. 1480년 킵차크 칸국이 카잔, 아스트라한, 크림 칸국으로 분열된 이후 모스크바를 중심으로 한 슬라브 루스의 세력이 회복되자 이들과 격렬하게 저항함으로써 다시 러시아 지역은 대혼란에 놓이게 된다. 러시아와 몽골의 전쟁은 시간만 끌고 얻는 것 없이 막대한 병력 손실 및 전사자만 내고 종결되었다. 동시에 크림 칸국의 군사가 모스크바까지 공격해와 약탈을 감행했고, 동부 지역에도 타타르족이 공격해와 약탈했지만 제대로 대응하지 못했고, 1560년까지 흉년이 계속되었으며, 전염병까지 확산되었다. 모스크바의 군사적 관심이 리보니아 지역에 집중되는 시기를 이용하여 크림 칸국의 지배자 데보레트 기레이(Deboret Girei)는 12만 명의 기병을 이끌고 여러 번 모스크바를 공격했고, 1572년 모로디(Morodi) 전투에서 패전하여 끝날 때까지 모스크바에 대한 공격은 계속되었다. 

러시아 모스크바 크레믈린, 미하일 대천사 성당 내부의 이반 4세와 두 아들의 관, 출처 : 필자의 직접 촬영

그러나 이어서 수십 년에 걸쳐 남부 국경지대는 노가이(Nogai) 오르다 및 크림 칸국의 약탈을 당해 지역 주민들이 연행되어 그들의 노예가 되었다. 녹지 지대의 관리 및 경비에는 연간 수만 명의 병사의 배치를 필요로 하여 그러한 부담은 모스크바를 소모시켜 사회적, 경제적 발전을 저해했다. 그러나 그 이전에 이반 4세는 카잔 칸국을 정벌한 바 있다. 카잔 칸국은 우르그 무함마드(Urg Muhammad)와 마프무데크(Mapmudek)가 카잔에 자리 잡고 창건한 것이 시초로 나타난다. 타타르스탄의 주민 대부분이 카잔 칸국의 후예들로 나타난다. 

이들은 이반 4세에게 패하기 전, 이미 궁정 내부는 심각한 분열을 맞이하고 있었고 그로 인하여 모스크바 측의 공격에 제대로 대응할 수 있는 상황은 아니었다. 카잔 칸국이 멸망한 후, 다음 상태는 아스트라한 칸국이었다. 이들은 수도 아스트라한을 중심으로 볼가 강, 우랄 강 중하류의 초원지대를 영유하고, 주로 수렵, 어로, 목축 활동에 종사하고 있었다. 지리적 위치로 인해 동서의 통과 무역이 번창하고 킵차크 칸국의 옛 수도인 사라이의 상업적 기능을 계승해서 다른 칸국들에 비해 발전을 빠르게 이루었다. 

그러나 정치적으로는 노얀(Noyan), 베그(Beg) 등의 귀족 계급 항쟁이 격심하였고, 대외적으로는 크림 칸국 및 노가이 가문 사이에 존립하고 있었기 때문에 이들에 비해 군사력이 취약한 아스트라한은 정치적인 간섭을 받아 왕권은 약화된 상태였다. 그러한 상황에서 1554년 카잔 칸국을 멸망시킨 러시아의 이반 4세의 침공을 받았고 군사적으로 밀린 아스트라한 칸국은 러시아에 멸망했다. 남은 것은 크림 칸국이었지만 이들은 다른 칸국들에 비해 군사적으로 가장 막강했다. 크림 칸국은 바투의 아우 토카티무르(Tokatimur)의 후예 하지 기레이(Haji Girei)가 킵차크 칸국으로부터 독립한 다음 건국한 몽골-타타르계 국가이다.

크림반도 남쪽 바그체 사라이(Bagche Saray)에 수도를 정하여 북방 및 동방과 연락하는 상업로인 흑해(黑海)로의 출구를 봉쇄해 중개 무역을 독점했고, 제노바 인의 식민지인 카파(Kafa)와 우호관계를 유지하면서 발전했다. 그러나 제2대 멘그리 기레이(Mengri Girei) 당시 오스만투르크 제국의 침략을 받아 속국이 되었으나 이후에도 육지로의 강력한 군사력을 가졌기 때문에 2세기에 걸쳐 존속하면서 러시아를 자주 공략했다. 그러다 1738년 러시아의 예카테리나 2세에 의해 멸망하면서 유럽러시아에서 몽골-타타르 세력은 완전히 사라지게 되었던 것이다.